Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM9Q9C026 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms