Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA7Q9BWT1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA7Q9BWT1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA7Q9BWT1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA7Q9BWT1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA7Q9BWT1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA7Q9BWT1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA7Q9BWT1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA7Q9BWT1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7Q9BWT1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms