Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms