Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP6Q9BRS8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms