Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MXRA8Q9BRK3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms