Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms