Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD5Q99666 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms