Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms