Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACCSQ96QU6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACCSQ96QU6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms