Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms