Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms