Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms