Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH12Q96NR8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms