Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD6Q96NK8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD6Q96NK8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD6Q96NK8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEUROD6Q96NK8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD6Q96NK8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms