Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF560Q96MR9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms