Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF488Q96MN9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms