Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC138Q96M89 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms