Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf72Q96LT7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms