Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms