Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms