Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms