Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms