Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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CCDC74AQ96AQ1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CCDC74AQ96AQ1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CCDC74AQ96AQ1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CCDC74AQ96AQ1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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CCDC74AQ96AQ1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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