Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2Q92932 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms