Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
PTPRUQ92729 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms