Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms