Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC3Q92529 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC3Q92529 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms