Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1280.5 ms