Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1Q8TAE8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1Q8TAE8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1Q8TAE8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1Q8TAE8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1Q8TAE8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1Q8TAE8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms