Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APPL2Q8NEU8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APPL2Q8NEU8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms