Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM3Q8NE01 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNNM3Q8NE01 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
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