Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms