Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFCDQ8IXH7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFCDQ8IXH7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms