Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF2Q8IX21 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms