Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAPLN4Q86UW8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAPLN4Q86UW8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAPLN4Q86UW8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms