Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms