Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHST3Q7LGC8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST3Q7LGC8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms