Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 413.1 ms