Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC171Q6TFL3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms