Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA5Q6Q788 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms