Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms