Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED27Q6P2C8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED27Q6P2C8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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