Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms