Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms