Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms