Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms