Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GFI1BQ5VTD9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms