Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms