Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HES3Q5TGS1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms