Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms